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第18章 基于单细胞测序的肿瘤微环境异质性解析

的首要步骤,常见的方法包括流式细胞分选、微流控技术和激光捕获显微切割等。流式细胞分选基于细胞表面标志物的表达,能够快速、高效地分离特定类型的细胞;微流控技术则通过微小通道和液滴的操控,实现单个细胞的精准分离;激光捕获显微切割则适用于从组织切片中精确获取特定位置的单个细胞。

(二)单细胞测序原理

单细胞测序主要包括单细胞转录组测序、单细胞基因组测序和单细胞表观遗传学测序等。单细胞转录组测序通过逆转录和扩增,获取单个细胞内的

mRNA

信息,反映细胞的基因表达状态;单细胞基因组测序可检测单个细胞中的基因突变、拷贝数变异等;单细胞表观遗传学测序则能揭示

DNA

甲基化、组蛋白修饰等表观遗传信息。

(三)单细胞测序技术的优势

单细胞测序能够揭示细胞群体中隐藏的稀有细胞类型和细胞状态,发现新的细胞亚型;同时,能够检测到细胞之间基因表达的细微差异,为理解细胞分化和功能提供更精确的信息。

三、肿瘤微环境中的细胞类型及其异质性

(一)肿瘤细胞异质性

肿瘤细胞本身具有显着的异质性,这表现在基因突变、染色体异常、基因表达模式等多个方面。单细胞测序揭示了不同肿瘤细胞在驱动基因突变、代谢通路活性和信号转导等方面的差异,这些差异导致肿瘤细胞的增殖能力、侵袭性和药物敏感性各不相同。

(二)免疫细胞异质性

TME

 

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